花单性,雌雄同株。雄花形成较迟,因花期不育,种子空粒多,2-3月开花,10-11月球果成熟,球果成熟时黄褐色或暗褐色。种子千粒重约1.75-2.28克,每公斤440000-580000粒,因无胚种子所占比例较大,发芽率仅5-11%。种子干藏,发芽力一年。
水杉育苗:种粒细小,幼苗柔弱,忌旱怕涝,圃地应选择地势平坦,排水方便,疏松的沙壤土。春季撒播或条播(行距25厘米),每亩播种量1公斤左右。种子较小有翅,应于无风时拌沙或细土播种。播后覆盖细土,厚以不见种子为度,略镇压,覆草,适宜在土温12度以上的早春播种,播后10天萌发,15天开始出土,20天出齐。幼苗初期生长缓慢,扎根不深,除经常浇水外,适当遮荫,以免日晒灼伤。一年生苗高40-70厘米,个别的可达100厘米以上。当前种子比较缺乏,也可采用硬枝或嫩枝扦插繁殖。