杂菌早期切除进入发酵室3日内,如发现个别菌袋表面出现点状霉点,属未形成孢子的轻度污染,可按照无菌操作规程,左手持菌袋倒置,右手持切除工具(直径1~1.5厘米,长25厘米左右的薄铁管,事先烧灼杀菌),打开菌袋用薄铁管对准污染切割,霉菌即顺管内排出,然后将菌袋封妥继续培养,成功率可达90%左右。重新杀菌再利用1、进入发酵室5天内,其他管理正常,如果发现70%以上的菌袋,种块不萌动,也没有杂菌污染。属杀菌时间短,应立即全部回锅重新杀菌后再利用。2、进入发酵室7日内,如果发现霉菌污染数量超过1/3,不论是何原因,必须挑出污染部分,重新杀菌再利用。3、进入发酵室10天后,如发现菌丝吃料特别慢或停止生长,如果原料没有问题,就是袋内缺氧造成,要清除残菌、补充新料,重新杂菌再利用,并改进封口措施。保本利用发菌晚期,发现杂菌严重污染,对好菌部分超过该袋的2/5者或好菌已占优势者,可选出继续培养作为出耳用,经验证明:千般情况下可收回成本。改种元蘑平时挑出的少量污染不能及时处理,可放在低温处集中起来,到黑木耳发菌全部结束后,再将污染袋补充少量新料,重新杀菌后改种元蘑,实践证明:不但污染率低,出菇能比新料种的提前7天左右。