麝鼠与其他多数啮齿动物一样,除繁殖期母鼠阴道口裂开外,一般都被封闭,因此从外形不易区分性别。在生产实践中我们可以采用以下几种方法加以区分:
肛门到外阴部之间的距离 公麝肛门到阴茎口之间的距离比母鼠肛门到尿道突起之间的距离长1/3左右。
公母麝鼠外阴部被毛特征 公麝会阴部被毛致密,而母鼠会阴部被毛稀疏,尤其靠近尿道突起后方,有明显的秃毛区。这个特征成年母鼠更为明显。
翻扒尿生殖孔来识别 将麝鼠保定后,用拇指和食指按压尿生殖孔两侧,使其外翻,若能露出紫红色圆形龟头则为公鼠,母鼠则呈粉红色空洞,此方法可以用于1月龄后的幼鼠的鉴别。
以排尿方向及特征来识别 公鼠多向头部方向排尿,而母鼠则多向后臀部方向排尿;公鼠排尿后,尿道口滞留有浓厚气味的乳白色分泌物,母鼠没有此特征。